Roche gab eine strategische Zusammenarbeit mit Broad Clinical Labs bekannt, um bahnbrechende Anwendungen mit der kürzlich vorgestellten Next-Generation-Sequencing-Technologie (NGS) von Roche zu entwickeln und zu pilotieren. Diese Zusammenarbeit wird sich darauf konzentrieren, die Leistungsfähigkeit der SBX-Technologie zu nutzen, um die klinische Genomik und die biomedizinische Forschung zu transformieren. Ziel ist es auch, die SBX-Technologie als Routineangebot für schnelle, skalierbare Sequenzierung für die Forschungsgemeinschaft des Broad Clinical Lab zu etablieren.

Im ersten Projekt wird Broad Clinical Labs die SBX-Technologie nutzen, um die Forschung zur triobasierten Sequenzierung des gesamten Genoms von schwerkranken Neugeborenen und ihren biologischen Eltern voranzutreiben. Dieses Programm zielt darauf ab, einen zukünftigen Zustand zu schaffen, in dem die Sequenzierung des gesamten Genoms zu einem routinemäßigen Bestandteil der klinischen Versorgung auf Neugeborenen-Intensivstationen (NICUs) wird, um präzise, zeitnahe Diagnosen und verbesserte Ergebnisse für Säuglinge mit Verdacht auf genetische Störungen zu ermöglichen.

„Die SBX-Technologie wurde sowohl mit Blick auf die klinische Wirkung als auch auf wissenschaftliche Entdeckungen entwickelt und bietet die nächste Generation schneller, skalierbarer Sequenzierungslösungen", sagte Matt Sause, CEO von Roche Diagnostics. „Die Zusammenarbeit mit Broad Clinical Labs, einem führenden Unternehmen in der klinischen Genomik- und Omics-Forschung, beschleunigt unsere Fähigkeit, dieses Versprechen einzulösen und durch modernste Genomtechnologie bessere Ergebnisse für Patienten zu erzielen."

„Die Integration der SBX-Technologie in klinische und translationale Pipelines eröffnet aufregende neue Möglichkeiten", sagte Niall Lennon, Vorsitzender und CSO bei Broad Clinical Labs. „Gemeinsam mit Roche wollen wir zeigen, wie eine schnelle, skalierbare und qualitativ hochwertige Sequenzierung sowohl die klinische Routineversorgung unterstützen als auch biomedizinische Innovationen vorantreiben kann."

Die SBX-Technologie stellt einen bedeutenden Sprung nach vorn im Bereich der Next-Generation-Sequenzierung dar und bietet ultraschnelle Durchlaufzeiten, außergewöhnliche Skalierbarkeit und Kosteneffizienz für eine Reihe von Sequenzierungsanwendungen. Die SBX-Technologie wurde auf eine hohe Durchsatzleistung mit einem flexiblen Workflow zugeschnitten, der einen schnellen Einsatz in zeitkritischen Umgebungen wie Neugeborenen-Intensivstationen (NICUs) und umfassende Multi-Omik-Forschungsforschung ermöglicht.

Im Rahmen der Zusammenarbeit werden auch die Möglichkeiten der SBX-Technologie für die RNA-Sequenzierung untersucht, die sowohl Bulk- als auch Einzelzellansätze umfasst. Diese Bemühungen werden sich darauf konzentrieren, die längeren Lesevorgänge der SBX-Technologie zu nutzen, um neuartige molekulare Erkenntnisse und Datentypen zu erschließen, die das Verständnis von Krankheitsmechanismen durch Forscher und die Identifizierung neuer therapeutischer Ziele neu gestalten könnten. Broad Clinical Labs ist eine hundertprozentige Tochtergesellschaft des Broad Institute of MIT und Harvard. Forscher des Broad Institute, die bei der Entwicklung und Anwendung von Einzelzellmethoden in einer Reihe von biomedizinischen Bereichen führend sind, werden die ersten Nutzer sein, die das neue System nutzen werden.

Die Zusammenarbeit zwischen Roche und Broad Clinical Labs spiegelt die gemeinsame Vision eines genomgestützten Gesundheitssystems wider und bekräftigt das Engagement beider Organisationen, die Präzisionsmedizin in großem Maßstab voranzutreiben.

Über die SBX-Technologie (Sequencing by Expansion)

Die bahnbrechende Next-Generation-Sequencing-Technologie von Roche wurde entwickelt, um die Einschränkungen traditioneller Sequenzierungsmethoden zu überwinden. Neben der hohen Genauigkeit bietet es auch eine beispiellose Kombination aus Flexibilität und Geschwindigkeit, was es zu einem vielseitigen Werkzeug für eine Vielzahl von genomischen Anwendungen macht.

Einer der Hauptvorteile der SBX-Technologie ist ihre Skalierbarkeit. Die Chemie ist mit einem fortschrittlichen CMOS-Sensormodul mit hohem Durchsatz gekoppelt, das ultraschnelle Base-Aufrufe und Analysen in Echtzeit ermöglicht. Dieses Modul ist so konzipiert, dass es zahlreiche Proben gleichzeitig verarbeiten kann, wodurch eine hochgradig skalierbare und flexible Architektur für eine kosteneffiziente Sequenzierung über verschiedene Projektgrößen hinweg geschaffen wird, von kleinen Studien bis hin zu großen Projekten mit Tausenden von Proben.

Durch diese Vielseitigkeit eignet sich die SBX-Technologie für eine Vielzahl von Anwendungen, darunter die Sequenzierung des gesamten Genoms, die Sequenzierung des gesamten Exoms und die RNA-Sequenzierung. Daher ist es nicht nur für Forschungslaboratorien vielversprechend, sondern auch für klinische Umgebungen, in denen detaillierte genomische Erkenntnisse von entscheidender Bedeutung sind. Mit der SBX-Technologie können Forscher neue und sich entwickelnde Forschungsanforderungen effizient erfüllen und so den Weg für bedeutende Fortschritte in unserem Verständnis von Genetik und Krankheiten ebnen, was letztendlich zu besseren Ergebnissen im Gesundheitswesen beiträgt.

Die SBX-Chemie wurde von Mark Kokoris und Robert McRuer erfunden, die Stratos Genomics mitbegründet haben. Stratos Genomics wurde 2020 von Roche übernommen.